一、消毒灭菌前的准备
      软式内镜诊疗结束后必须就地进行床旁预处理；清洗前要进行测漏（至少每天一次），手工刷洗、冲洗后再放入清洗消毒机或进入四槽法手工处置流程。
二、终末漂洗水的要求
      WS507标准规定了软式内镜高水平消毒后终末漂洗水的细菌总数应≤10CFU/100mL，终末漂洗水应使用孔径≤0.2μm的滤膜过滤；应使用灭菌处理的无菌水对灭菌内镜进行终末漂洗。实际使用中，要加强终末漂洗水的微生物污染监测，及时更换滤膜和清除管道内可能的生物膜污染。
三、终末漂洗后的干燥
      普通棉布易湿透，无纺布不吸水，二者都易使软式内镜干燥中发生污染，建议选择表层吸水底层阻水的专业内镜干燥巾。WS507标准要求干燥气枪要使用“洁净压缩空气”，因此需要配置医用空气压缩机组，或带过滤器的气泵和气枪，保证干燥气体的卫生质量。
四、清洗消毒设备设施
      每日清洗消毒工作结朿时应对清洗槽、漂洗槽等彻底刷洗，采用合适的消毒液进行消毒；更换消毒剂时应彻底刷洗消毒槽，避免底部残渣影响消毒剂质量。定期消毒清洗消毒机的槽面、灌流管道和管路，避免交叉污染。
五、转运和储存的污染
      使用加盖配套盒转运已消毒的软式内镜；控制储存环境的温湿度（24℃、70%），保持镜库或镜柜表面的清洁很重要，不能采用紫外线或臭氧对储镜空间进行消毒，以免对内镜表面材料氧化伤害。化学浸泡灭菌的软式内镜需配置专业的清洗框，灭菌后使用无菌袋套装再转运；应使用配套清洗框的专业储镜柜储存，用洁净过滤的热空气彻底干燥内镜管道，避免储存过程中污染。